纳他霉素作为食品防腐剂，应用非常广泛。Bunger等将山梨酸酯防腐剂，纳他霉素和二羟基碳酸盐组 成的抗菌混合物处理饮料和其他食品的制作过程，特别是果汁饮料、钙饮料、茶饮料、含牛奶固型物和蛋白质的饮料等，可以有效防止饮料中微生物学生长。
在酱油中添加15mg／kg的纳他霉素，可有效抑制酵母菌的生长与繁殖，防止白花的出现，而且纳他霉素使用成本低，对酱油的品质和风味无任何影响。J0hn等研究了把纳他霉素和环糊精形成包含络和物，不仅能极大地增加纳他霉素的水溶性，而不影响它的原始结构和抗菌活性，同时便于将纳他霉素溶液均匀喷雾于奶酪表面。HaanDebenRudof等8J发明了纳他霉素和其他抗菌素制成混合的粉剂，用来处理香肠和干酪等食品。这种方法可以将香肠在12℃下至少保存6O天以上，而不发生霉变。纳他霉素还可以应用干果酱、黄油、桔汁、沙拉酱防霉方面.
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